罗梦奇

2024年08月30日 15:50    点击:[]



罗梦奇


邮箱mengqiluo@ucas.ac.cn


研究方向:计算生物,文本挖掘


教育及科研经历

2024.07 – 至今 国科大杭州高等研究院,生命与健康科学学院,助理研究员

2022.12 – 2024.05 深圳大学,管理学院,校聘副研究员

2020.7 – 2022.12 中国科学技术大学,生命科学学院/香港中文大学(深圳),瓦谢尔计算生物研究院,博士后研究员

2016.09 – 2020.06 武汉大学,信息管理学院,博士学位

2018.10 – 2019.10 美国伊利诺伊大学芝加哥分校,医学院/伊利诺伊大学香槟分校,信息科学学院,联合培养博士研究生/访问学者

2015.07 – 2016.08 香港城市大学,翻译及语言学系,科研助理

2014.07 – 2015.01 香港理工大学,医疗科技及资讯学系,科研助理

2012.07 – 2014.07 香港浸会大学,计算机系,教学助理/科研助理

2011.09 – 2012.11 香港浸会大学,理学院,硕士学位

2007.09 – 2011.06 天津师范大学,计算机与信息工程学院,学士学位


主持与参与项目

国家自然科学基金委员会,青年科学基金项目,面向生物医学文本的知识自动总结研究,在研,主持

中国博士后科学基金面上,生物医学文献中蛋白质翻译后修饰的知识挖掘与知识库构建,结题,主持

广东省自然科学基金面上,基于机器学习的抗菌肽预测及其生物活性研究,结题,参与

国家自然科学基金委员会,面上项目,一种基于深度学习神经网络的自闭症谱系障碍诊断模型设计,结题,参与

国家自然科学基金委员会,青年科学基金项目,基于深度语义挖掘的引文推荐多样化研究,结题,参与


代表性论文

[1] Xiaohong Zhu†, Mengqi Luo†, Ke An, Danfeng Shi, Tingjun Hou, Arieh Warshel, Chen Bai. Exploring the activation mechanism of metabotropic glutamate receptor 2[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2024, 121(21): e2401079121.

[2] Mengqi Luo, Shangfu Li, Yuxuan Pang, Lantian Yao, Renfei Ma, Hsi-Yuan Huang, Hsien-Da Huang, Tzong-Yi Lee. Extraction of microRNA–target interaction sentences from biomedical literature by deep learning approach[J]. Briefings in Bioinformatics, 2023, 24(1): bbac497.

[3] Wei Lu, Mengqi Luo*, Zhenyu Zhang, Guobiao Zhang, Heng Ding, Haihua Chen, Jiangping Chen. Result diversification in image retrieval based on semantic distance[J]. Information Sciences, 2019, 502: 59-75.

[4] Zhongyan Li†, Shangfu Li†, Mengqi Luo, Jhih-Hua Jhong, Wenshuo Li, Lantian Yao, Yuxuan Pang, Zhuo Wang, Rulan Wang, Renfei Ma, Jinhan Yu, Yuqi Huang, Xiaoning Zhu, Qifan Cheng, Hexiang Feng, Jiahong Zhang, Chunxuan Wang, Justin Bo-Kai Hsu, Wen-Chi Chang, Feng-Xiang Wei, Hsien-Da Huang, Tzong-Yi Lee. dbPTM in 2022: an updated database for exploring regulatory networks and functional associations of protein post-translational modifications[J]. Nucleic Acids Research, 2021.

[5] Mengqi Luo, Bowen Xue, Ben Niu. A comprehensive survey for automatic text summarization: Techniques, approaches and perspectives[J]. Neurocomputing, 2024: 128280.

[6] Mengqi Luo, Cohen, A. M., Addepalli, S., & Smalheiser, N. R. (2020). Identifying main finding sentences in clinical case reports. Database, 2020.

[7] Mengqi Luo, Zhongyan Li, Shangfu Li, Tzong-Yi Lee. (2021). A representation and deep learning model for annotating ubiquitylation sentences stating E3 ligase-substrate interaction. BMC bioinformatics, 22(1), 1-18.

[8] Yue Zhang†, Mengqi Luo†, Peng Wu, Song Wu, Tzong-Yi Lee, Chen Bai Application of computational biology and artificial intelligence in drug design[J]. International journal of molecular sciences, 2022, 23(21): 13568.

[9] Ke An†, Xianzhi Yang†, Mengqi Luo†, Junfang Yan, Peiyi Xu, Honghui Zhang, Yuqing Li, Song Wu, Arieh Warshel, Chen Bai. Mechanistic study of the transmission pattern of the SARS-Cov-2 Omicron variant. PROTEINS: Structure, Function, and Bioinformatics, 2023

[10] John Lee, & Mengqi Luo. (2016). Personalized Exercises for Preposition Learning. Proceedings of ACL-2016 System Demonstrations.


个人学术网页:

https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=reafa9gAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate


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