罗梦奇

2024年08月30日 15:50    点击:[]



罗梦奇


邮箱mengqiluo@ucas.ac.cn


研究方向计算生物,数据挖掘,人工智能


教育及科研经历

2024.07 – 至今       国科大杭州高等研究院生命与健康科学学院,助理研究员

2020.07 – 2022.12  中国科学技术大学生命科学学院/香港中文大学(深圳)瓦谢尔计算生物研究院,博士后研究员

2016.09 – 2020.06  武汉大学信息管理学院,博士学位

2018.10 – 2019.10  美国伊利诺伊大学芝加哥分校医学院/伊利诺伊大学香槟分校信息科学学院,联合培养博士研究生/访问学者

2015.07 – 2016.08  香港城市大学,科研助理


主持与参与项目

国家自然科学基金委员会,青年科学基金项目,面向生物医学文本的知识自动总结研究,在研,主持

浙江省尖兵科技计划项目,面向重大疾病的计算生物学关键技术及应用,在研,参与

中国博士后科学基金面上,生物医学文献中蛋白质翻译后修饰的知识挖掘与知识库构建,结题,主持

广东省自然科学基金面上,基于机器学习的抗菌肽预测及其生物活性研究,结题,参与

国家自然科学基金委员会,面上项目,一种基于深度学习神经网络的自闭症谱系障碍诊断模型设计,结题,参与

国家自然科学基金委员会,青年科学基金项目,基于深度语义挖掘的引文推荐多样化研究,结题,参与


代表性论文

[1] Mengqi Luo†, Xiaohong Zhu†, Chen Bai, Arieh Warshel, Luonan Chen. Mining lysine post-translational modification sites by integrating protein language model representations with structural context[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2026, 123(7): e2529141123.    

[2] Xiaohong Zhu†, Mengqi Luo†, Ke An, Danfeng Shi, Tingjun Hou, Arieh Warshel, Chen Bai. Exploring the activation mechanism of metabotropic glutamate receptor 2[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2024, 121(21): e2401079121.

[3] Mengqi Luo, Shangfu Li, Yuxuan Pang, Lantian Yao, Renfei Ma, Hsi-Yuan Huang, Hsien-Da Huang, Tzong-Yi Lee. Extraction of microRNA–target interaction sentences from biomedical literature by deep learning approach[J]. Briefings in Bioinformatics, 2023, 24(1): bbac497.

[4] Wei Lu, Mengqi Luo*, Zhenyu Zhang, Guobiao Zhang, Heng Ding, Haihua Chen, Jiangping Chen. Result diversification in image retrieval based on semantic distance[J]. Information Sciences, 2019, 502: 59-75.

[5] Zhongyan Li†, Shangfu Li†, Mengqi Luo, Jhih-Hua Jhong, Wenshuo Li, Lantian Yao, Yuxuan Pang, Zhuo Wang, Rulan Wang, Renfei Ma, Jinhan Yu, Yuqi Huang, Xiaoning Zhu, Qifan Cheng, Hexiang Feng, Jiahong Zhang, Chunxuan Wang, Justin Bo-Kai Hsu, Wen-Chi Chang, Feng-Xiang Wei, Hsien-Da Huang, Tzong-Yi Lee. dbPTM in 2022: an updated database for exploring regulatory networks and functional associations of protein post-translational modifications[J]. Nucleic Acids Research, 2021.

[6] Mengqi Luo, Bowen Xue, Ben Niu. A comprehensive survey for automatic text summarization: Techniques, approaches and perspectives[J]. Neurocomputing, 2024: 128280.

[7] Ke An†, Xianzhi Yang†, Mengqi Luo†, Junfang Yan, Peiyi Xu, Honghui Zhang, Yuqing Li, Song Wu, Arieh Warshel, Chen Bai. Mechanistic study of the transmission pattern of the SARS-Cov-2 Omicron variant. PROTEINS: Structure, Function, and Bioinformatics, 2023


个人学术网页:

https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=reafa9gAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate


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