生命与健康科学学院首席教授，中国科学院院士，中科院分子植物卓越中心研究员。

分子微生物学家，现任中科院上海营养与健康研究所生物医学大数据中心首席科学家，中科院合成生物学重点实验室专家委员会主任。曾参与启动中国基因组学、生物信息学、蛋白质组学、转录组学研究，克隆若干遗传病致病基因及中国微生物基因组测序。2003年主持SARS分子流行病学和SARS冠状病毒进化研究，并取得成就。此后，在蛋白质乙酰化组、肠道微生物组、合成生物学等领域作出了若干开创性的工作。

2005年，获何梁何利科技奖，2014年，获美国普度大学农学院荣誉博士。